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國家信息農(nóng)業(yè)工程技術中心學術報告
報告題目:基于機器學習和計算機視覺的多尺度作物表型組研究及其在稻麥育種中的應用/Combining machine learning and computer vision to establish novel multi-scale crop phenomics methods and their applications in rice and wheat breeding
報告人:周濟 教授
報告人單位:南京農(nóng)業(yè)大學作物表型組學學交叉研究中心
報告時間:9月1日(周日)14:00
報告地點:生科樓A5002
內(nèi)容摘要:
機器學習、計算機視覺、高通量數(shù)據(jù)分析等技術與生命科學的交叉結(jié)合正逐漸為植物研究開辟一系列全新的研究方向。通過學科交叉的方法可以基于多元數(shù)據(jù)集動態(tài)生成非常復雜的規(guī)則,從而完成對生物大數(shù)據(jù)的分類和復雜趨勢的預測,進而建立強大的基因到表型(Genotype-Phenotype)的分型系統(tǒng)來精確表征細胞、器官、組織和群體在不同發(fā)育階段和不同環(huán)境中表型組差異的遺傳學基礎。近幾年來,這種交叉研究方法正被越來越多的頂尖生物團隊應用于各類植物研究中。在本次報告中,報告人將結(jié)合英國諾維奇科學研究院和南京農(nóng)業(yè)大學作物表型組學研究中心所開展的多尺度植物表型組研究,介紹植物表型采集平臺及相應的高通量表型分析方法。包括如何實現(xiàn)從高空、田間、溫室到細胞層面等不同空間尺度開展植物表型的性狀獲取。在報告中,報告人將著重介紹AirSurf(自動航空圖像分析平臺)和CropQuant(分布式田間作物監(jiān)測系統(tǒng))在智慧農(nóng)業(yè)和小麥育種中的應用。基于正在開展的中英研究項目,報告人將討論如何整合物聯(lián)網(wǎng)技術、分布式計算、嵌入式人工智能和大數(shù)據(jù)管理等技術手段(如CropSight和SeedGerm),為植物研究提供可靠的表型組學分析平臺。同時,在結(jié)合具體生物學問題的基礎上,講解如何整合植物生長、氣候模式和表型特征等信息,量化基因型與環(huán)境互作(GxE)以及針對產(chǎn)量、質(zhì)量等動態(tài)性狀的提取分析。由于表型組學遠未完善,報告中也將討論如何合理使用新的技術手段,以期為我國未來的植物研究產(chǎn)生積極影響。
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